مجلس الأمناء الحالي
يتألف مجلس أمناء المركز من شخصيات عامة من مختلف أقطار الوطن العربي. ويشرف المجلس على نشاط المركز، وأعمال اللجنة التنفيذية، ويؤمن موارد المركز، ويراقب إنفاقها، ويصادق على الموازنة، ويختار لجنة تنفيذية من بين أعضائه، ويصادق على تعيين المدير العام للمركز، ويجتمع كل عام.
أعضاء مجلس الأمناء بترتيب أبجدي:
أحمد يوسف أحمد (مصر)، أسعد عبد الرحمن (فلسطين/ الأردن)، اسماعيل الشطي (الكويت)، باسل البستاني (العراق)، جميل مطر (مصر)، خديجة الصبار (المغرب)، خولة مطر (البحرين)، سمير عبد الهادي (فلسطين/ الأردن)، سيف بن هاشل المسكري (سلطنة عُمان)، طاهر كنعان (فلسطين/ الأردن)، الطيب الدجاني (فلسطين/الأردن)، عبد الله السيد ولد أباه (موريتانيا)، عبد الملك المخلافي (اليمن)، عروس الزبير (الجزائر)، عصام نعمان (لبنان)، علي الدين هلال (مصر)، علي فخرو (البحرين)، كمال خلف الطويل (فلسطين/اميركا)، لبيب قمحاوي (فلسطين /الأردن)، محمد سعيد الطيب (السعودية)، محمد فايق (مصر)، محي الدين عميمور (الجزائر)، منير شفيق (فلسطين)، ناصيف حتي (لبنان)، نيفين مسعد (مصر)، يوسف الحسن (الإمارات)، يوسف الدرويش (قطر)، يوسف شويري (لبنان).
ويرأس الدكتور علي محمد فخرو مجلس أمناء المركز بعد انتخابه بالاجماع لدورة ثانية مدتها أربع سنوات في اجتماع مجلس أمناء المركز الذي عُقد في 20 كانون الثاني/يناير 2023، كما تم التجديد لدورة ثانية لرئيس اللجنة التنفيذية الدكتور أحمد يوسف أحمد وأعضاء اللجنة الأستاذ الطيب الدجاني والدكتور علي الدين هلال والدكتور كمال خلف الطويل والدكتورة نيفين مسعد والدكتور يوسف الحسن والدكتور يوسف شويري.
كما يضم مجلس الأمناء أعضاء شرف ساهموا في تأسيس المركز ودعم القضايا القومية والعربية وشاركوا على مدار سنوات طويلة بفعالية في مجلس أمناء المركز.
اللجنة التنفيذية
تتألف من سبعة أعضاء ينتخبهم مجلس الأمناء من بين أعضائه لمدة أربع سنوات وتتولى مهام المجلس في ما بين فترات انعقاده، وتجتمع بشكل دوري خلال العام.
وفي اجتماع مجلس أمناء المركز الذي عُقد في 20 كانون الثاني/يناير 2023، تم التجديد لدورة ثانية لرئيس اللجنة التنفيذية الدكتور أحمد يوسف أحمد وأعضاء اللجنة الأستاذ الطيب الدجاني والدكتور علي الدين هلال والدكتور كمال خلف الطويل والدكتورة نيفين مسعد والدكتور يوسف الحسن والدكتور يوسف شويري.
الجهاز الاداري
يتولى إدارة المركز مدير عام تختاره اللجنة التنفيذية لمدة أربع سنوات ويصادق على التعيين مجلس الأمناء. ويشرف المدير العام على الجهاز الاداري للمركز ويقدم تقارير دورية عن نشاط المركز وأوضاعه المالية للجنة التنفيذية ومجلس الأمناء. تم تعيين الأستاذة لونا مفلح أبوسويرح مديرة عامة للمركز في آيار/مايو 2017.